L’expertise en matière de santé de l’hôpital Cochin – Port-Royal est renforcée par la présence de plusieurs centres de référence :

• Centre de référence des maladies rhumatologiques inflammatoires des maladies auto-immunes et interféronopathies systémiques de l’enfant (Pr. Allanore)
• Centre de référence des maladies osseuses constitutionnelles (Prs. Roux et Koumakis)
• Centre de référence des maladies rares du métabolisme du calcium et du phosphate (Pr Briot)
• Centre de référence des maladies neuromusculaires Nord/Est/Ile-de-France (Pr. Wahbi)
• Centre de référence des maladies pulmonaires rares de l’adulte (Pr. Martin)
• Centre de référence des maladies rares en ophtalmologie (Pr. Brézin)
• Centre de référence de la mucoviscidose et affections liées à une anomalie de CFTR (Pr. Burgel)
• Centre de référence des maladies vasculaires du foie (Pr. Sogni)
• Centre de référence des anorexies mentales à début précoce (Pr. Blanchet)
• Centre de référence des déficits immunitaires héréditaires (Pr. Mouthon)
• Centre de référence des maladies bulleuses auto-immunes (Pr. Dupin)
•  Centre de référence des maladies rares de l’hypophyse (Pr. Assié)
• Centre de référence des maladies endocriniennes rares de la croissance et du développement (Pr. Assié)
• Centre de référence des maladies rares du développement génital : du fœtus à l’adulte (Pr. Bertherat)
• Centre de référence des maladies rares de la thyroïde et des récepteurs hormonaux (Pr. Groussin Rouiller)
• Centre de référence des pathologies rares de l’insulinosécrétion et de l’insulino-sensibilité (Pr. Dubois-Laforgue)
• Centre de référence des polyposes digestives génétiques de l’adulte (Pr. Dhooge)
• Centre de ressources et de compétences des maladies hémorragiques rares (Prs. Stieltjes et Roussel-Robert)
• Centre de référence des pathologies gynécologiques rares (Pr. Plu-Bureau)
• Centre de référence des maladies auto-immunes et auto inflammatoires systémiques rares de l’adulte d’Ile-de-France Est et Ouest (Pr. Mouthon)
• Centre de référence des maladies rares de la peau et des muqueuses d’origine génétique (MAGEC NORD) (Pr. Guégan)
• Centre de référence des maladies rares de la surrénale (Pr. Bertherat)
• Centre de référence des infections ostéo-articulaires complexes (CRIOAC)